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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

（新春见闻）春运首日：中国多地开启“趣暖返乡”******

　　中新社北京1月7日电 　1月7日，2023年中国铁路春运正式拉开帷幕。中国各地车站迎来返乡客流，旅客的“归家路”不乏趣味与温暖。

　　当日9时15分，阳光洒落深圳北站候车室内，5名来自铁路部门的书法家，正现场书写春联赠送旅客，献上新春祝福。独创的“福兔”惟妙惟肖，成了旅客们的“抢手货”。

　　与此同时，在福建漳州火车站候车厅里，随处可见“春运连着你我他”红色横幅，旅客们手持“兔年吉祥”的立牌互动拍照，客运人员还将手写春联和玉兔玩偶送给游客。

　　在广西南宁东站列车车厢内，到处张贴着喜庆的福字，悬挂着红灯笼，处处透着“年味”。南宁局集团公司南宁客运段列车长卢其明与列车员李妍静为乘客表演了一曲民歌《只有山歌敬亲人》。

　　广州南站候车室大厅里，一座“流动的博物馆”吸引游客驻足。记者了解到，这是广州铁路博物馆举办的“能流动的博物馆、会说话的老物件”主题展。粤汉铁路的百年股票、新中国成立前的铁路手提信号灯、不同年代的火车票等212件珍贵藏品，首次在高铁站与旅客“零距离”见面。

　　除此之外，广州南站携手广州医科大学团委开展“情暖回家路防疫伴你行”公益活动，邀请10名医疗人员坐诊，为有需要的旅客进行免费义诊，并向来往的旅客宣传科普防疫防病知识和健康常识，派发铁路职工设计的“防疫四字经”文创书签，让旅客的旅途更安心。

　　春运期间，南宁局集团公司组织开展山歌表演、写赠春联、送壮族绣球等体验活动，让乘客在旅途中感受浓浓的节日氛围。“通过精彩的活动为每个返乡旅客送上新春祝福，希望我们真情暖心的服务可以温暖旅客的回家路。”卢其明说。

　　为保证市民出行安全顺畅，漳州站党支部书记郑超表示，铁路部门将精准实施“一日一图”，根据实际客流量，通过加开列车、动车组重联、普速列车加挂车厢等方式适时增加运力，以更谨慎态度全力应对春运客流变化，保证旅客在春运期间出行安全顺畅。(完)

　　(参与作者：郭军、廖珍妹、王琪、林洁琪)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）